政治史是本研究所的传统领域。长期以来，以辛亥革命为主攻方向，取得了瞩目的成绩。在辛亥百年之后，同仁们一面继续在辛亥革命领域耕耘，一面将研究视野拓展为20世纪中国革命，既关注激烈的暴力革命，也关注温和的政治革命、思想革命乃至家庭革命、心灵革命。为此，发起成立了“20世纪中国革命”研究群，组织了“孙文共同研究班”，统合研究所内外力量开展相关研究。我们相信，既然20世纪是一个革命的世纪，则通过对20世纪各种革命的探究，不惟可以加强政治史的研究，亦可深化对20世纪历史全貌的认识。

面向当前海内外学术界转换研究范式和扩大研究空间的学科前沿发展趋向，进一步放宽视野，将中国近代社会经济置于更绵长的时间和更广阔的空间进行研究，既详加梳理和考察中国近代社会经济演进的基本历程及特征，又探讨和分析中外经济互动对近代中国社会转型的影响及作用，进而揭示中西经济演进历程的“分流”和“合流”，瞩目的不只是认知体系上的思考，更是中国经济现代化与社会关系重构过程中人文价值的反思，即为转型过程中的中国商业文明建构历史传承。

思想文化史研究室发源于章开沅先生开创的辛亥人物和思潮研究，经罗福惠教授的长期拓展，研究范围延伸到近代中国思想文化的变迁及其对社会转型的影响，具体领域包括思想史、文化史、学术史、教育史、大学与社会、劳工意识与社会运动等，旨在通过各阶层、各地区、各群体社会意识的多元考察，探索全球化格局下近代中国历史转型的不平衡展开。研究特色在于：将文化机构特别是近代大学的变迁与思想文化的演进结合起来考察；将精英文化的传播与劳工运动的发展结合起来考察；将学界常常不够注意的台港地区的思想文化作为中国近代思想文化史有机构成部分加以考察。目前集体攻关的重点是进行近代中国大学史的研究。

宗教社会史研究室缘起于章开沅先生创办的中国教会大学史研究中心。中心长期以教会大学和中国基督教史为研究重点，其学术成就和学术服务在海内外学界享有盛誉。近年来我们整合并融入佛教史、道教史等研究力量，重组以宗教社会史为取向的科研团队。本团队主要研究对象为明清以来的佛教、道教、基督新教、天主教等主流宗教，在细致梳理各派兴衰历程和发展规律的同时，全面探究其与中国社会的互动和互融，深度解析其与中国政治、经济、文化的关系和关联。社会变迁下的宗教转型、政教互动及文化调适，是本团队的研究重点。